Главная синагога была построена в 1912 году по проекту архитектора A. Л. Генриха на месте синагоги XIX века, уже не вмещавшей всех прихожан. Обе были возведены на средства купцов, потому второе название — Купеческая. Синагогу также называли торговой из-за близости к рынку. У небольшого прямоугольного здания был симметричный центральный фасад, обращенный на север, c 2-мя двухъярусными ризалитами по бокам, в которых находились резные двери женского и мужского входов. На каждом ярусе было по 5 арочных окон, при этом арочная галерея с ажурными балясинами 2-го яруса была закрытой.

В 1929 году, уже изрядно разрушенная после землетрясения 1927 года, синагога была закрыта, а в начале 30-х здание передали под склад евпаторийскому заводу безалкогольных напитков, который его значительно перестроил под свои нужды. От творения Генриха остались лишь лопатки ризалитов да объемное оформление оконных и дверных ниш, зашитое в современную облицовку, в качестве которой в 2009 году был использован розовый иерусалимский камень. Здание утратило свое религиозное и историческое значение. Однако сегодня концертная площадка перед синагогой — главное место проведения летних культурных мероприятий и фестиваля на улице Караимской.